Protein–RNA interactions for Protein: Q16825

PTPN21, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 21, humanhuman

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Length 1,174 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN21Q16825 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 TRAJ22-201ENST00000390515 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
PTPN21Q16825 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PTPN21Q16825 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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