Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
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RTN1Q16799 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
RTN1Q16799 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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RTN1Q16799 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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RTN1Q16799 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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RTN1Q16799 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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RTN1Q16799 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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RTN1Q16799 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
RTN1Q16799 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RTN1Q16799 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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RTN1Q16799 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
RTN1Q16799 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RTN1Q16799 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RTN1Q16799 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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RTN1Q16799 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RTN1Q16799 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RTN1Q16799 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RTN1Q16799 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RTN1Q16799 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
RTN1Q16799 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
RTN1Q16799 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
RTN1Q16799 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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