Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RPE65Q16518 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.28
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RPE65Q16518 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RPE65Q16518 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
RPE65Q16518 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
RPE65Q16518 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RPE65Q16518 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RPE65Q16518 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RPE65Q16518 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RPE65Q16518 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RPE65Q16518 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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RPE65Q16518 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RPE65Q16518 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RPE65Q16518 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RPE65Q16518 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RPE65Q16518 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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RPE65Q16518 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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RPE65Q16518 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RPE65Q16518 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
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