Protein–RNA interactions for Protein: Q16384

SSX1, Protein SSX1, humanhuman

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Length 188 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX1Q16384 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
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SSX1Q16384 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
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SSX1Q16384 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
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SSX1Q16384 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
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SSX1Q16384 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
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SSX1Q16384 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
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SSX1Q16384 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SSX1Q16384 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
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SSX1Q16384 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
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SSX1Q16384 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
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SSX1Q16384 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
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SSX1Q16384 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
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SSX1Q16384 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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SSX1Q16384 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.68□□□□□ -2.52
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SSX1Q16384 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
SSX1Q16384 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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