Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 RICTOR-202ENST00000357387 9543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
E2F4Q16254 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 ZNF658B-202ENST00000615961 3375 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 HMGN2P23-201ENST00000456759 269 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
E2F4Q16254 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 MIR3064-201ENST00000581130 66 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
E2F4Q16254 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 279.2 ms