Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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SS18Q15532 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
SS18Q15532 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
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SS18Q15532 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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SS18Q15532 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SS18Q15532 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SS18Q15532 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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SS18Q15532 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
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SS18Q15532 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SS18Q15532 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SS18Q15532 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SS18Q15532 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SS18Q15532 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SS18Q15532 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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SS18Q15532 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
SS18Q15532 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SS18Q15532 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SS18Q15532 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SS18Q15532 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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SS18Q15532 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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SS18Q15532 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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SS18Q15532 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SS18Q15532 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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SS18Q15532 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SS18Q15532 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SS18Q15532 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SS18Q15532 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SS18Q15532 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SS18Q15532 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SS18Q15532 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SS18Q15532 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SS18Q15532 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SS18Q15532 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SS18Q15532 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
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