Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDK3Q15120 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDK3Q15120 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDK3Q15120 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDK3Q15120 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDK3Q15120 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDK3Q15120 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDK3Q15120 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDK3Q15120 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDK3Q15120 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDK3Q15120 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDK3Q15120 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.53□□□□□ -2.49
PDK3Q15120 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.59□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PDK3Q15120 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.6□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.63□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PDK3Q15120 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 258.3 ms