Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
PDCD1Q15116 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
PDCD1Q15116 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
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