Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RAB39AQ14964 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RAB39AQ14964 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RAB39AQ14964 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RAB39AQ14964 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
RAB39AQ14964 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RAB39AQ14964 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.16□□□□□ -2.22
RAB39AQ14964 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
RAB39AQ14964 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.1 ms