Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
RFTN1Q14699 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.77□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC0.77□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 MIR302B-201ENST00000362188 73 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.76□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.74□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
RFTN1Q14699 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms