Protein–RNA interactions for Protein: Q14112

NID2, Nidogen-2, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID2Q14112 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NID2Q14112 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NID2Q14112 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NID2Q14112 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NID2Q14112 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NID2Q14112 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NID2Q14112 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NID2Q14112 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NID2Q14112 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NID2Q14112 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.41□□□□□ -2.34
NID2Q14112 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NID2Q14112 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NID2Q14112 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
NID2Q14112 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NID2Q14112 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NID2Q14112 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NID2Q14112 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NID2Q14112 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NID2Q14112 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NID2Q14112 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NID2Q14112 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU6-255P-201ENST00000516957 105 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NID2Q14112 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NID2Q14112 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NID2Q14112 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NID2Q14112 DLEU2_5.2-201ENST00000610606 84 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NID2Q14112 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NID2Q14112 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
NID2Q14112 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NID2Q14112 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NID2Q14112 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NID2Q14112 Y_RNA.454-201ENST00000384224 113 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NID2Q14112 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NID2Q14112 SNORA20-201ENST00000384662 132 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NID2Q14112 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NID2Q14112 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NID2Q14112 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NID2Q14112 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NID2Q14112 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NID2Q14112 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NID2Q14112 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NID2Q14112 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NID2Q14112 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NID2Q14112 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NID2Q14112 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NID2Q14112 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
NID2Q14112 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NID2Q14112 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NID2Q14112 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NID2Q14112 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.37□□□□□ -2.35
NID2Q14112 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NID2Q14112 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NID2Q14112 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NID2Q14112 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NID2Q14112 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NID2Q14112 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NID2Q14112 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NID2Q14112 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NID2Q14112 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NID2Q14112 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NID2Q14112 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NID2Q14112 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NID2Q14112 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NID2Q14112 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NID2Q14112 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.36□□□□□ -2.35
NID2Q14112 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NID2Q14112 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NID2Q14112 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NID2Q14112 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NID2Q14112 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NID2Q14112 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NID2Q14112 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
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