Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 MIR532-201ENST00000385025 91 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
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PKP1Q13835 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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PKP1Q13835 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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PKP1Q13835 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PKP1Q13835 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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PKP1Q13835 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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PKP1Q13835 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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PKP1Q13835 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
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PKP1Q13835 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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PKP1Q13835 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
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PKP1Q13835 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PKP1Q13835 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
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