Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
CACNA1SQ13698 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
CACNA1SQ13698 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
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