Protein–RNA interactions for Protein: Q13546

RIPK1, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK1Q13546 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RIPK1Q13546 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.1□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RIPK1Q13546 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
RIPK1Q13546 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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