Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
MSLNQ13421 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.34□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 AL603914.1-201ENST00000401964 204 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 AC108866.1-201ENST00000503073 2339 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.3□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
MSLNQ13421 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
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