Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
ERCC8Q13216 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
ERCC8Q13216 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 254.4 ms