Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.98□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
GPS1Q13098 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.92□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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GPS1Q13098 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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GPS1Q13098 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
GPS1Q13098 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.9□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
GPS1Q13098 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
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