Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
FOXF2Q12947 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 RNU6-652P-201ENST00000365488 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 RNU6-480P-201ENST00000384332 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
FOXF2Q12947 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 303.8 ms