Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.45□□□□□ -2.34
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GTF3C1Q12789 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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GTF3C1Q12789 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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GTF3C1Q12789 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.44□□□□□ -2.34
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GTF3C1Q12789 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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GTF3C1Q12789 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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GTF3C1Q12789 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
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GTF3C1Q12789 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.43□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
GTF3C1Q12789 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
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GTF3C1Q12789 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
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GTF3C1Q12789 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
GTF3C1Q12789 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
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