Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
FOXO1Q12778 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.69□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.69□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 MIR4714-201ENST00000580728 77 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
FOXO1Q12778 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
FOXO1Q12778 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
FOXO1Q12778 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
FOXO1Q12778 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
FOXO1Q12778 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 355.2 ms