Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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PGGT1BP53609 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
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PGGT1BP53609 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
PGGT1BP53609 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
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PGGT1BP53609 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
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PGGT1BP53609 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
PGGT1BP53609 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
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