Protein–RNA interactions for Protein: O94967

WDR47, WD repeat-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR47O94967 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
WDR47O94967 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
WDR47O94967 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
WDR47O94967 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
WDR47O94967 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
WDR47O94967 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
WDR47O94967 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
WDR47O94967 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
WDR47O94967 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
WDR47O94967 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
WDR47O94967 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
WDR47O94967 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
WDR47O94967 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
WDR47O94967 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
WDR47O94967 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
WDR47O94967 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
WDR47O94967 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
WDR47O94967 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
WDR47O94967 U7.7-201ENST00000459276 60 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
WDR47O94967 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
WDR47O94967 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
WDR47O94967 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
WDR47O94967 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
WDR47O94967 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
WDR47O94967 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
WDR47O94967 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
WDR47O94967 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
WDR47O94967 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
WDR47O94967 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
WDR47O94967 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
WDR47O94967 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
WDR47O94967 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
WDR47O94967 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
WDR47O94967 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
WDR47O94967 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
WDR47O94967 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.01□□□□□ -2.25
WDR47O94967 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1□□□□□ -2.25
WDR47O94967 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1□□□□□ -2.25
WDR47O94967 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1□□□□□ -2.25
WDR47O94967 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1□□□□□ -2.25
WDR47O94967 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
WDR47O94967 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1□□□□□ -2.25
WDR47O94967 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
WDR47O94967 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1□□□□□ -2.25
WDR47O94967 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1□□□□□ -2.25
WDR47O94967 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1□□□□□ -2.25
WDR47O94967 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
WDR47O94967 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
WDR47O94967 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
WDR47O94967 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
WDR47O94967 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
WDR47O94967 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
WDR47O94967 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
WDR47O94967 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
WDR47O94967 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
WDR47O94967 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
WDR47O94967 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
WDR47O94967 UBL5P1-201ENST00000507979 193 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
WDR47O94967 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
WDR47O94967 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
WDR47O94967 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
WDR47O94967 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
WDR47O94967 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
WDR47O94967 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
WDR47O94967 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
WDR47O94967 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
WDR47O94967 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
WDR47O94967 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
WDR47O94967 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
WDR47O94967 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
WDR47O94967 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
WDR47O94967 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
WDR47O94967 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
WDR47O94967 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
WDR47O94967 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
WDR47O94967 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
WDR47O94967 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC0.95□□□□□ -2.26
WDR47O94967 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 225 ms