Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
CTIFO43310 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CTIFO43310 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CTIFO43310 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CTIFO43310 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CTIFO43310 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CTIFO43310 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CTIFO43310 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CTIFO43310 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CTIFO43310 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
CTIFO43310 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTIFO43310 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTIFO43310 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTIFO43310 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTIFO43310 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTIFO43310 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTIFO43310 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTIFO43310 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTIFO43310 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTIFO43310 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CTIFO43310 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTIFO43310 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTIFO43310 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTIFO43310 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTIFO43310 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTIFO43310 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CTIFO43310 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTIFO43310 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTIFO43310 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTIFO43310 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTIFO43310 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTIFO43310 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTIFO43310 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTIFO43310 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CTIFO43310 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CTIFO43310 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTIFO43310 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTIFO43310 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTIFO43310 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTIFO43310 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CTIFO43310 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTIFO43310 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTIFO43310 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTIFO43310 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTIFO43310 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
CTIFO43310 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
CTIFO43310 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTIFO43310 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTIFO43310 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTIFO43310 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTIFO43310 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTIFO43310 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTIFO43310 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
CTIFO43310 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
CTIFO43310 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTIFO43310 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTIFO43310 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTIFO43310 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
CTIFO43310 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
CTIFO43310 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTIFO43310 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTIFO43310 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTIFO43310 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
CTIFO43310 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
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