Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
RRN3Q9NYV6 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.61□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
RRN3Q9NYV6 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255 ms