Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 MTND5P34-201ENST00000568888 325 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
UHRF1Q96T88 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
UHRF1Q96T88 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.2 ms