Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.09□□□□□ -2.39
PHF3Q92576 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC0.09□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.07□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PHF3Q92576 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.41
PHF3Q92576 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PHF3Q92576 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PHF3Q92576 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PHF3Q92576 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PHF3Q92576 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PHF3Q92576 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PHF3Q92576 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PHF3Q92576 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PHF3Q92576 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PHF3Q92576 AC091304.10-201ENST00000641554 121 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PHF3Q92576 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PHF3Q92576 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PHF3Q92576 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PHF3Q92576 RNU4-71P-201ENST00000516258 113 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PHF3Q92576 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PHF3Q92576 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PHF3Q92576 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PHF3Q92576 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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