Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
ZNF548Q8NEK5 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU1-98P-201ENST00000458992 160 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
ZNF548Q8NEK5 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
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