Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP53Q70EK8 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP53Q70EK8 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP53Q70EK8 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP53Q70EK8 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP53Q70EK8 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP53Q70EK8 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
USP53Q70EK8 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP53Q70EK8 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP53Q70EK8 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP53Q70EK8 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP53Q70EK8 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP53Q70EK8 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.72□□□□□ -2.13
USP53Q70EK8 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP53Q70EK8 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
USP53Q70EK8 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
USP53Q70EK8 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
USP53Q70EK8 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
USP53Q70EK8 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 194.6 ms