Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.48□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
GEN1Q17RS7 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
GEN1Q17RS7 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
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