Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC-1.64□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
RTL8BQ17RB0 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-1.67□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
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RTL8BQ17RB0 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
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RTL8BQ17RB0 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
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RTL8BQ17RB0 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
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RTL8BQ17RB0 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
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RTL8BQ17RB0 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
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RTL8BQ17RB0 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
RTL8BQ17RB0 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
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RTL8BQ17RB0 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
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