Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNA5SP292-201ENST00000390974 118 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 SNORD90-201ENST00000391145 111 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 FAM13A-AS1_1.1-201ENST00000612555 119 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
PKN1Q16512 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
PKN1Q16512 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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