Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
SEC23AQ15436 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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SEC23AQ15436 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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SEC23AQ15436 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
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SEC23AQ15436 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-970P-201ENST00000516312 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
SEC23AQ15436 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
SEC23AQ15436 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
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