Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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PTPRKQ15262 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRKQ15262 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRKQ15262 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
PTPRKQ15262 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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PTPRKQ15262 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
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PTPRKQ15262 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPRKQ15262 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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PTPRKQ15262 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
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PTPRKQ15262 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
PTPRKQ15262 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
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PTPRKQ15262 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
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PTPRKQ15262 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRKQ15262 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRKQ15262 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
PTPRKQ15262 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
PTPRKQ15262 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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PTPRKQ15262 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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PTPRKQ15262 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
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PTPRKQ15262 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
PTPRKQ15262 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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