Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PSMD6Q15008 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PSMD6Q15008 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 AC079466.2-201ENST00000585394 185 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 Y_RNA.52-201ENST00000362760 96 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PSMD6Q15008 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 HOTAIRM1_4.1-201ENST00000617934 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PSMD6Q15008 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC0.25□□□□□ -2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.8 ms