Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NCAPHQ15003 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 AC141846.1-201ENST00000568348 142 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
NCAPHQ15003 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NCAPHQ15003 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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