Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 AL020996.3-201ENST00000606617 222 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
NFIXQ14938 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RNU2-19P-201ENST00000517288 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RNU7-53P-201ENST00000516705 60 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 PNRC2-204ENST00000579103 171 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RNU7-73P-201ENST00000458743 63 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
NFIXQ14938 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NFIXQ14938 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
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