Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,016 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SCN5AQ14524 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-1321P-201ENST00000390905 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU7-45P-201ENST00000459460 63 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-1190P-201ENST00000410811 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR206-201ENST00000384872 86 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.25□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SCN5AQ14524 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 228.2 ms