Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 MIR4460-201ENST00000577862 86 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNU7-80P-201ENST00000459562 61 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 AC021613.1-201ENST00000623880 111 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-0.66□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.51
CACNA1CQ13936 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 MIR548K-201ENST00000408406 116 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 SNORD77.4-201ENST00000516158 81 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CACNA1CQ13936 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
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