Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Length 1,077 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 AC026421.1-201ENST00000519101 163 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 SNORA26.6-201ENST00000391256 115 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 HMGN1P33-201ENST00000432945 451 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RAPGEF1Q13905 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 MIR6841-201ENST00000637129 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 SNORD123-201ENST00000459473 70 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
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