Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 AC016907.1-201ENST00000419483 435 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-1.38□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 MT-TY-201ENST00000387409 66 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.39□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
KRR1Q13601 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 SNORD115-35-201ENST00000365122 82 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-1.42□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC-1.43□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
KRR1Q13601 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.8 ms