Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RNU6-22P-201ENST00000384355 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 AL512326.2-201ENST00000426359 151 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RNU6-1258P-201ENST00000516911 111 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 MIRLET7F2-201ENST00000385277 83 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RNU6-479P-201ENST00000516348 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 SNORD12C-201ENST00000386307 89 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
SNAPC2Q13487 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SNAPC2Q13487 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
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