Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SF3B2Q13435 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 SNORA18-201ENST00000384416 132 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 RNU6-733P-201ENST00000410759 104 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SF3B2Q13435 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 DEFB131E-201ENST00000532329 154 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 AC008781.2-201ENST00000502205 2480 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SF3B2Q13435 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SF3B2Q13435 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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