Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 RNU4ATAC4P-201ENST00000516307 126 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC-1.63□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TCOF1Q13428 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC-1.66□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 UBE2V2P2-201ENST00000587677 504 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-1.69□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TCOF1Q13428 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
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