Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
XRCC4Q13426 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 Y_RNA.318-201ENST00000365131 97 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-0.73□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 RNU7-137P-201ENST00000516788 62 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 SCARNA15-202ENST00000516881 127 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 AL022718.1-201ENST00000412004 84 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-0.77□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 RNA5SP144-201ENST00000410846 116 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
XRCC4Q13426 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.79□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNA5SP33-201ENST00000516687 98 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNU7-113P-201ENST00000459273 62 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 MIR1270-201ENST00000459320 83 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
XRCC4Q13426 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
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