Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
NR1H3Q13133 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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NR1H3Q13133 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
NR1H3Q13133 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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