Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF2Q12933 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF2Q12933 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF2Q12933 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF2Q12933 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF2Q12933 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF2Q12933 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF2Q12933 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TRAF2Q12933 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.15□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 SNORA63.5-201ENST00000363548 123 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RNU6-396P-201ENST00000365369 105 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 Y_RNA.430-201ENST00000384081 110 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RNU6-1086P-201ENST00000410930 100 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RNU6-94P-201ENST00000607728 107 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 AC008163.1-202ENST00000636004 2889 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 MRPL35P3-201ENST00000421557 364 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RNU7-79P-201ENST00000516082 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 SNORD67.1-201ENST00000516618 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RNA5SP261-201ENST00000410536 106 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RNU4-69P-201ENST00000410677 143 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 SNORD115-20-201ENST00000365099 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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TRAF2Q12933 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RNA5SP237-201ENST00000410414 113 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
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TRAF2Q12933 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
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TRAF2Q12933 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
TRAF2Q12933 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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TRAF2Q12933 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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TRAF2Q12933 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAF2Q12933 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAF2Q12933 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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TRAF2Q12933 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAF2Q12933 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAF2Q12933 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAF2Q12933 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAF2Q12933 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
TRAF2Q12933 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
TRAF2Q12933 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRAF2Q12933 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRAF2Q12933 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRAF2Q12933 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TRAF2Q12933 RNU7-35P-201ENST00000517174 62 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRAF2Q12933 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRAF2Q12933 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TRAF2Q12933 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
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