Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 U6.109-201ENST00000636749 87 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
PTPRJQ12913 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 RNU6-893P-201ENST00000458841 100 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 Y_RNA.171-201ENST00000363760 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 RNU6-1292P-201ENST00000383856 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 TRAJ2-201ENST00000390535 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
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PTPRJQ12913 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-0.55□□□□□ -2.5
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PTPRJQ12913 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 Y_RNA.221-201ENST00000364248 96 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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PTPRJQ12913 Y_RNA.366-201ENST00000365540 102 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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PTPRJQ12913 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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PTPRJQ12913 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 IGHVIII-67-2-201ENST00000519849 88 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 AC105081.1-201ENST00000617727 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 Y_RNA.470-201ENST00000384307 117 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.58□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
PTPRJQ12913 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
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