Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Knop1Q9Z2Q2 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms