Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Mbd3Q9Z2D8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms