Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z205

Rfxank, DNA-binding protein RFXANK, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxankQ9Z205 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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RfxankQ9Z205 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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RfxankQ9Z205 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
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RfxankQ9Z205 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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RfxankQ9Z205 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
RfxankQ9Z205 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms